Русский   |    English
Для слабовидящих
 

Владимир Борисович Брюхин

Владимир Борисович Брюхин

Идентификационные коды автора: Web of Science ResearcherID, Scopus Author ID, ORCID iD, Google Scholar

Ученая степень, ученое звание: доктор биологических наук

Должность: ведущий научный сотрудник

Электронная почта: VBrukhin@binran.ru

Телефон: +7 (812) 372-54-41

Направления исследований:

  • Функциональная генетика и геномика.
  • Амфимиксис и апомиксис.
  • Биология развития.
  • Эпигенетика.
  • Сравнительная геномика.
  • Биология полового и бесполого размножения растений.

Ключевые слова: Полногеномная сборка и аннотация, Boechera, Arabidopsis, апомиксис, мейоз, апомеиоз, диплоспория, псевдогамия, геномика, гетерозиготность, женский гаметофит

Образование и опыт работы:

1983–1988 — Ленинградский государственный университет, Биолого-почвенный факультет.

Научные проекты:

Руководитель:

  • 2022. Приглашенный исследователь программы Фулбрайта.
  • 2020–2023. РФФИ №20-54-46002 «Филогенетический и функциональный анализ генов, ассоциированных с апомиксисом у представителей рода Boechera».
  • 2016–2018. РФФИ №16-54-21014 «Секвенирование, сборка и аннотация высоко гетерозиготного генома апомиктического растения Boechera divaricarpa».
  • 2015–2016. РФФИ №15-54-45001 «Закрепление гибридной силы посредством бесполого размножения - генетический скрининг, направленный на индукцию апомиксиса у цветковых растений».
  • 2005–2006. Грант для продвижения молодых ученых фонда Stiefel-Zangger (Цюрих, Швейцария).
  • 2003–2004. Novartis Исследовательский грант (Базель, Швейцария).
  • 1999–2000. Стипендия Шведского института (Стокгольм, Швеция).
  • 1997–1998. Грант Министерства образования, Исследований и Технологии Франции (Париж, Франция).
  • 1996–1997. Стипендия Агроуниверситета в Вагинингене (Нидерланды).
  • 1997. The Company of Biologists Ltd (Cambridge, UK) — Травэлгрант.
  • 1994–1995. Грант Российской Академии Наук для молодых ученых.

Исполнитель:

  • 2013–2020. Мегагрант от Министерства Науки и Образования РФ для создания лаборатории геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского. Руководитель проф. Ст. Дж. ОБрайен.
  • 2011–2013. Leverhulme Trust (Лондон, Великобритания). Руководитель: Др. Питер Доенер.
  • 2008–2011. CRUK (Coca Research, Великобритания). Руководитель: проф. Майк Вилкинсон.

Прочие проекты:

  • 2011–2013 Leverhulme Trust (London, UK). Исполнитель.
  • 2008–2011. CRUK (Coca Research UK), Dutch Government for cocoa research. Исполнитель.

Научные мероприятия:

Участие:

  • 26th IASPRR Plant Reproduction Conference (ICSPR2022). Czech Republic, Prague, June 20–24, 2022.
  • Будущее биомедицины. Россия, Владивосток, сентябрь 2019 г.
  • VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров. Россия, Санкт-Петербург, июнь 2019 г.
  • XXVII Plant and Animal Conference. USA San Diego CA, January 2019.
  • International Conference on Arabidopsis Research (ICAR). Finland, Turku, June 2018.
  • 25th ICSPR (International Conference on Sexual Plant Reproduction). Japan, Gifu, June 2018.
  • XXVI Plant and Animal Conference. USA San Diego CA, January 2018.
  • ESHG conference. Denmark, Copenhagen, May 2017.
  • 5th Plant Genomics and Gene Editing Congress. Netherlands, Amsterdam, March 2017.
  • XXV Plant and Animal Conference. USA, San Diego CA, January 2017.
  • Latest Advances in Plant Development and Environmental Response. Japan, Awaji, November 2016.
  • ASHG. USA, Baltimore, October, 2015.
  • Oslo Epigenetics Symposium. Norway, Oslo, April 2014.
  • Genome 10K Meeting. USA Fort Lauderdale, FL, April 2013.
  • XXI International Congress on Sexual Plant Reproduction. UK, Bristol, August 2010.
  • World AgriGenomic Congress. Belgium, Brussels, July 2010.
  • World Epigenetic Congress. Germany, Berlin, September 2009.
  • Plant Science Wales. UK Cardiff, January 2009.
  • American Society of Plant Biologists. USA, Chicago, June 2007.
  • Plant Biology Symposium and Plant Proteomics Mini-Symposium. USA Columbia, Missouri; May 21–24, 2007.
  • XII Embryology Conference. Poland, Krakow Sept. 5–7, 2005.
  • 18th International Congress Sexual Plant Reproduction Research. China, Beijing, August 2004.
  • Conference on Plant Gametophytes. Switzerland, Ascona, June 2003.
  • Workshop on Embryogenesis and Developmental Regulation in Plants. Italy Turin, March 6–7, 2003.
  • 17th International Congress Sexual Plant Reproduction Research. Poland, Lublin, July 2002.
  • Conference «Signal Transduction meets Functional Genomics». Denmark, Copenhagen, June 11–12, 2001.
  • Forest Biotechnology’99. UK, Oxford, July 1999.
  • 15th International Congress on Sexual Plant Reproduction Research. Netherlands, Wageningen, August 1998.
  • 18th Congress of SPPS. Sweden Uppsala, June 1998.
  • 5th Conference of European Embryologists. Poland, Lublin, Sept.1995.

Членство в научных обществах:

Редакционная деятельность:

  • Член редакционной коллегии журнала «Epigenomes»
  • Член редакционной коллегии журнала «Plants»

Избранные публикации:

Виноградова Г.Ю., Синельникова Н.В., Ташкин К.М., Брюхин В.Б. Развитие женских репродуктивных структур у видов Boechera (Brassicaceae) при половом и апомиктичном способах репродукции. Ботанический журнал. 2023. 108(12): 1100–1118.

Soltis D.E., Mavrodiev E.V., Brukhin V. et al. Tragopogon pratensis: Multiple introductions to North America, circumscription, and the formation of the allotetraploid T. miscellus. TAXON. 2023. 72(4): 848–861.

Ochkalova S., Korchagin V. ... Brukhin V. et al. Darevskia valentini involved in formation of several parthenogenetic species. Genes. 2022. 13(9): 1569.

Bakin E., Sezer F., Özbilen A., Kilic I., Uner B., Rayko M., Taskin K.M., Brukhin V. Phylogenetic and expression analysis of CENH3 and APOLLO genes in sexual and apomictic Boechera species. Plants (MDPI), Basel Switzerland, special issue Genomic Study and Molecular Genetic Regulation of Apomixis. 2022. 11(3): 387.

Brukhin V., Albertini E. Epigenetic Modifications in Plant Development and Reproduction. Epigenomes. 2021. 5(4): 25.

Ryakhovsky S.S., Dikaya V.A. ... Brukhin V.B. et al. De novo transcriptome assembly and annotation of parthenogenetic lizard Darevskia unisexualis and its parental ancestors Darevskia valentini and Darevskia raddei nairensis. Data Brief. 2021. 6;39: 107685.

Брюхин В.Б., Андрусенко Е.В. Функциональная генетика и геномика: учебное пособие. Санкт-Петербург: Изд. Университета ИТМО, 2021. 113 c.

Бакин Е.А., Сезер Ф., Райко М. П., Таскин К. М., Брюхин В.Б. Филогенетический и функциональный анализ генов, ассоциированных с апомиксисом, CENH3 и APOLLO. Актуальная биотехнология. 2020. 81–85.

Brukhin V. Epigenetic Control in Plants. Epigenomes. 2020. 4: 11.

Zhernakova D.V., Brukhin V., Malov S. et al. Genome-wide sequence analyses of ethnic populations across Russia. Genomics. 2020. 112(1): 442–458.

Brukhin V., Osadtchiy J.V., Florez-Rueda A. M., Smetanin D., Nobre M.S., Bakin E., Grossniklaus U. The Boechera Genus as a Resource for Apomixis Research. Frontiers in Plant Science — Special Issue Plant Breeding. 2019. 10: 392.

Brukhin V., Baskar R. A brief note on genes that trigger components of apomixis. Journal of Biosciences. 2019 44: 45.

Kliver S., Rayko M. ... Brukhin V. et al. Assembly of the Boechera retrofracta Genome and Evolutionary Analysis of Apomixis-Associated Genes. Genes (Basel). 2018. 9(4): pii: E185.

Yurchenko A., Yudin N. ... Brukhin V. et al. Genome-wide genotyping uncovers genetic profiles and history of the Russian cattle breeds. Heredity. 2018. 120: 125–137.

Brukhin V. Is sex irreplaceable? Towards the molecular regulation of apomixis. Int. J. Plant Reproduct. Biol. 2017. 9(2): 153–169.

Осадчий Я.В., Наумова Т.Н., Брюхин В.Б. Апомиксис в роде Boechera (Brassicaceae) текущее состояние проблемы. Ботанический журнал. 2017. 102(12): 1587–1607.

Брюхин В.Б. Молекулярно-генетическая регуляция апомиксиса. Генетика. 2017. 53(9): 1001–1024.

Oleksyk T.K., Brukhin V., O’Brien S.J. Putting Russia on the genome map. Science. 2015. 13;350(6262): 747.

Oleksyk T.K., Brukhin V., O’Brien S.J. The Genome Russia project: closing the largest remaining omission on the world Genome map. Gigascience. 2015. 4: 53.

Dobrynin P., Liu S., Tamazian G. ... Brukhin V. et al. Genomic legacy of the African cheetah, Acinonyx jubatus. Genome Biol. 2015. 16: 277.

Tamazian G., Simonov S., Pontius J. ... Brukhin V. et al. Annotated Features of Domestic Cat — Felis Catus. GigaScience. 2014. 3: 13.

Brukhin V., Jaciubek, M., Bolaños Carpio A., Kuzmina V., Grossniklaus U. Female Gametophytic mutants of Arabidopsis thaliana identified in a gene Trap Insertional Mutagenesis Screen. Int. J. Dev. Biol. 2011. 55: 73–84.

Dumbliauskas E., Lechner E., Alioua M. ... Brukhin V. et al. The Arabidopsis CUL4-DDB1 complex interacts with MSI1 and is required to maintain MEA parental imprinting. EMBO J. 2011. 30 (4):731–43.

Chekanova J.A., Gregory B.D., Reverdatto S.V. ... Brukhin V. et al. Genome-Wide High-Resolution Mapping of Exosome Substrates Reveals Hidden Features in the Arabidopsis Transcriptome. Cell. 2007. 131(7): 1340–1353.

Brukhin V., Curtis M.D., Grossniklaus U. The angiosperm female gametophyte: no longer forgotten generation. Current Science. 2005. 89(11).

Brukhin V., Gheyeselinck J., Gagliardini V., Genschik P., Grossniklaus U. The RPN1 subunit of the 26S proteasome in Arabidopsis is essential for embryogenesis. The Plant Cell. 2005. 17(10): 2723–37.

Thomann A., Brukhin V., Dieterle M., Gheyeselinck J., Grossniklaus U., Genschik P. Arabidopsis CUL3A and CUL3B genes are essential for normal embryogenesis. The Plant Journal. 2005. 43(3): 437-448.

Brukhin V.B. Histochemical and immunohistochemical aspects of embryogenesis. In: Embryology of flowering plants Terminology and Concepts. Ed. Prof. T.Batygina. Enfield, NH, USA, Science Publisher Inc. 2004. 2: 370–373.

Brukhin V., Hernould M., Gonzalez N., Chevalier C., Mouras A. Flower development schedule in tomato Lycopersicon esculentum cv. sweet cherry. Sex. Plant Reproduction. 2003. 15(6): 311–320.

Grossniklaus U., Moore J.M., Brukhin V. et al. Engineering of apomixis in crop plants: what can we learn from sexual model systems / In: I.K. Vasil (Ed) Plant Biotechnology 2002 & Beyond, Kluwer Academic Publishers: Dordrecht. 2003. 309–314.

Brukhin V., Clapham D., Elfstrand M., von Arnold S. Basta tolerance as a selectable and screening marker for transgenic plants of Norway spruce. Plant Cell Reports. 2003. 19: 899–903.

Filonova L.H., Bozhkov P.V., Brukhin V.B., Daniel G., Zhivotovsky B., von Arnold S. Two waves of programmed cell death occur during formation and development of somatic embryos in the gymnosperm Norway spruce. J Cell Sci. 2000. 113(24): 4399–4411.

Батыгина Т.Б., Брюхин В.Б. Эмбриогенез пионовых. Эмбриология цветковых растений. Терминология и концепции. Санкт-Петербург: Изд. Мир и Семья, 1997. 2: 539–544.

Brukhin V.B., Moleva I.R., Filonova L.H., Grakhov V.P., Blume Ya.B, Bozhkov P.V. Proliferative activity of callus culture of Taxus baccata in relation to anticancer diterpenoid taxol biosynthesis. Biotechnology Letters (Chapman & Hall, London). 1996. 18(11): 1309–1314.

Brukhin V.B., Bozhkov P.V. Female gametophyte development and embryogenesis in Taxus baccata L. Acta Soc. Bot.Pol. 1996. 65(1–2): 135–139.

Tchorzewska D., Brukhin V.B., Bednara J. Organelle layers at meiocyte of Psilotum nudum. Acta Soc.Bot.Pol. 1996. 65(1–2): 91–96.

Brukhin.V., Zemanek A. The manuscripts of Russian translations of the Polish herbal /Zielnik/ (1613) by Syreniusz in St. Petersburg. Kwartalnik historii nauki i techniki (Warsaw). 1996. 41(3–4): 189–195.

Brukhin V.B. Somatic embryogenesis in vitro and in vivo. Tranasactions of Vth Conf. of Botanists in St. Petersburg. St. Petersburg, 1994. 97–100.

Brukhin V.B., Batygina T.B. Morphogenesis in culture of peony in vitro. Biologia Plantarum supplement. 1994. 36: 78.

Brukhin V.B., Batygina T.B. Embryo culture and somatic embryogenesis in culture of Paeonia anomala L. Phytomorphology. 1994. 44(3–4): 151–157.

© Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, 2003–2024