Екатерина Робертовна Котлова

Екатерина Робертовна Котлова

Идентификационные коды автора: Web of Science ResearcherID, Scopus Author ID, РИНЦ, ORCID iD

Ученая степень, ученое звание: кандидат биологических наук

Должность: ведущий научный сотрудник

Электронная почта: EKotlova@binran.ru

Телефон: +7 (812) 372-54-08

Направления исследований:

  • Разработка и оптимизация методов исследования липидома и отдельных структурных групп липидов (глицеро- и сфинголипиды, стерины, тритерпеноиды) методами HPLC-ESI-MS/MS, MALDI-MS, GC-MS.
  • Изучение структурного разнообразия липидов грибов и растений различных систематических и экологических групп; метаболизма и функциональной активности липидов, включая участие в клеточном сигналинге, регуляции роста и морфогенеза.

Ключевые слова: Липидом, глицеролипиды, сфигнолипиды, клеточный сигналинг, стерины, тритерпеноиды, метаболизм липидов

Образование и опыт работы:

1994 — окончила Санкт-Петербургский государственный университет, биолого-почвенный факультет, кафедра физиологии и биохимии растений.
1996-1999 — аспирантура Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН.
2000 — степень кандидата биологических наук по специальностям микология, физиология и биохимия растений (Спецсовет БИН РАН).

1994-1996 — стажер-исследователь лаборатории лихенологии и бриологии Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН.
1996-1999 — аспирант, а затем младший научный сотрудник лаборатории лихенологии и бриологии Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН.
2000-2008 — научный сотрудник, а затем старший научный сотрудник лаборатории лихенологии и бриологии Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН.
2005-2012 — по совместительству старший научный сотрудник лаборатории биохимии грибов Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН.
2008-2014 — старший научный сотрудник лаборатории аналитической фитохимии Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН.
2014 — по настоящее время — ведущий научный сотрудник лаборатории аналитической фитохимии Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН.

Научные проекты:

Государственное задание

  • 2012-2021. № АААА-А18-118032390136-5. «Оценка изменений корреляционной структуры метаболитных сетей в процессе роста и развития грибов и растений с позиций системной биологии».

Руководитель:

  • 2020 – по настоящее время. РФФИ № 20-04-01092 «Механизмы образования и ремоделирования молекулярного разнообразия фосфатидилхолинов и их физиологическая роль в грибной клетке».
  • 2010-2012. Федеральная целевая программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 гг. (мероприятие № 1.2.2 Проведение научных исследований научными группами под руководством кандидатов наук) ГК № П1167. Рафтообразующие липиды в системе регуляции полярного роста клеток высших грибов и растений.
  • 2009-2011. РФФИ № 09-04-01634 «Участие сфинголипид-зависимых сигнальных систем в регуляции ростовых процессов у грибов и растений».
  • 2009. РФФИ № 09-04-90717-моб_ст Работа молодого российского ученого Валитовой Ю.Н. в Ботаническом институте им. В.Л. Комарова РАН.
  • 2005-2007. РФФИ № 05-04-48385 «Мембранные глицеро- и сфинголипиды как биорегуляторы ростовых процессов у грибов и криптогамных растений».
  • 2004. Федеральная целевая программа «Интеграция науки и высшего образования России на 2002-2006 годы», № Д4088/601, Научная стажировка в Биологическом научном центре Университета Кардифа (Кардиф, Великобритания).
  • 2002-2004. РФФИ № 02-04-49600 «Индукция синтеза бетаиновых липидов как универсальная адаптивная реакция грибов и криптогамных растений на стрессовые воздействия различной природы».
  • 2002-2004. Грант Президента Российской Федерации «Молодые кандидаты наук», МК-1286.2003.04, «Участие триметиламмонийных липидов в защитных реакциях растений».

Исполнитель:

  • 2015-2017. РФФИ №15-29-02604офи-м. «Метаболомный подход к изучению биологического разнообразия сосудистых растений».
  • 2015-2017. РФФИ №15-04-06975а. «Механизмы алкалофилии у мицелиальных грибов».
  • 2014-2016. РФФИ №14-04-01795a. «Динамика метаболитного состояния в контексте системного подхода к изучению процессов роста и развития высших растений и грибов».
  • 2009-2011. Федеральная целевая программа «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 гг. (мероприятие № 1.3.1 Проведение научных исследований молодыми учеными - кандидатами наук). ГК № П1373. Реакции компенсаторного замещения индивидуальных классов мембранных липидов в растительной клетке.
  • 2007-2009. РФФИ № 07-04-01520 «Роль липидов и углеводов в приобретении термоустойчивости у мицелиальных грибов».
  • 2006-2008. РФФИ № 06-04-49043 «Структурно-функциональные особенности формирования генеративной стадии у базидиальных макромицетов в условиях чистой культуры».
  • 1999-2001. INTAS № 97-30778. Poikilotroph response of lichens and free living cyanobacteria and fungi on rocks in extreme environments as a clue for the search for biodeteriorative processes and extraterrestrial life.

Прочие проекты:

  • 2009-2011 «Анализ метаболитных сетей в связи с исследованием ростовых процессов у грибов и растений».
  • 2006-2008. № 01.2.006 09639. «Структурно-функциональные особенности макромицетов различных таксономических и экологических групп ex situ».
  • Программа фундаментальных исследований ОБН РАН «Фундаментальные основы управления биологическими ресурсами», Проект 2.1.1.5.

Научные мероприятия:

Участие:

  • Lipid MAPS ans MAP/UK Training school in Lipidomics. Cardiff, UK, 2021. Online report.
  • IX Съезд общества физиологов растений России «Физиология растений – основа создания растений будущего». Казань, 2019.
  • 10th International Conference Photosynthesis and Hydrogen Energy Research for Sustainability, Санкт-Петербург, 2019.
  • II Междисциплинарный микологический форум. Москва, 2010.
  • Рабочее совещание FEBS «Microbial lipids, from genomics to lipidomics». Вена, Австрия, 2010.
  • VII конгресс по липидомике «Lipids in all states». Биарриц, Франция, 2010.
  • III Международный конгресс Общества европейских микробиологов (FEMS). Гетенбург, Швеция, 2009.
  • 50-й Международная конференция «Bioscience of lipids». Германия, Регенсбург, 2009.
  • Международный симпозиум «Липиды и оксилипины растений». Казань, 2008.
  • V Всероссийский конгресс по медицинской микологии. Москва, 2007.
  • 48th International Conference on the Bioscience of Lipids. Финляндия, Турку, 2007.
  • XV Congress of European Mycologists. Санкт-Петербург, 2007.
  • Международный симпозиум «Signalling systems of plant cells: role in adaptation and immunity». Казань, 2006.
  • Международный конгресс Euro Fed Lipid по проблемам фундаментальных исследований и биотехнологии липидов животных, растений и микроорганизмов. Мадрид, Испания, 2006.
  • Международный семинар по проблемам медицинской и биологической масс-спектрометрии. Упсала, Швеция, 2005.
  • Совещание, посвященное проблемам изучения липидов растений (в рамках «Тимирязевских чтений»). Москва, 2005.
  • 16-й Международный симпозиум «Plant Lipids». Будапешт, Венгрия, 2004.
  • 15-й Международный симпозиум «Plant Lipids». Оказаки, Япония, 2002.
  • Международный симпозиум «Signaling Systems of Plant Cells». Москва, 2001.
  • 3-й Международный междисциплинарный симпозиум «General Biochemistry, Biotechnology and Environment». Москва, 2001.

Членство в научных обществах:

Научно-организационная и педагогическая деятельность:

Чтение учебных курсов

    Санкт-Петербургский государственный университет, биолого-почвенный факультет, кафедра физиологии и биохимии растений:

  • Авторский курс лекций «Современные проблемы липидологии», 20 часов, I курс магистратуры.
  • Практический курс «Методы анализа липидов», 36 часа, I-II курсы магистратуры.
  • Летний практикум по физиологии и биохимии растений, 24 часа, IV курс бакалавриата.

    Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН:

  • Авторский курс лекций для аспирантов «Липиды грибов и растений: структурное разнообразие, метаболизм, функции», 4 часа (короткая программа), 20 ч.

Руководство аспирантами:

  • Киселёва М.А. Тема диссертации «Метаболизм мембранных липидов у свободноживущих и симбиотических зеленых водорослей рода Pseudococcomyxa в условиях дефицита фосфора», защита состоялась 10.12.2008.
  • Сеник С.В. Тема диссертации «Мембранные липиды в формировании морфогенетического ответа у базидиальных грибов», защита состоялась 19.12.2012.

Избранные публикации:

Senik S.V., Kolker T.L., Kotlova E.R., Vlasov D.Yu., Shavarda A.L., Puzansky R.K., Psurtseva N.V. Lipid and metabolite profiling of Serpula lacrymans under freezing stress. Curr Microbiol. 2021. In Press.

Senik S.V., Psurtseva N.V., Shavarda A.L., Kotlova E.R. Role of lipids in the thermal plasticity of basidial fungus Favolaschia manipularis. Canadian Journal of Microbiology. 2019. 65(12): 870-879.

Bondarenko S.A., Ianutsevich E.A., Danilova O.A., Tereshina V.M., Kamzolkina O.V., Bilanenko E.N., Grum-Grzhimaylo A.A., Kotlova E.R. Membrane lipids and soluble sugars dynamics of the alkaliphilic fungus Sodiomyces tronii in response to ambient pH. Extremophiles. 2017. 21(4): 743-754.

Ianutsevich E.A., Danilova O.A., Groza N.V., Kotlova E.R., Tereshina V.M. Heat shock response of thermophilic fungi: membrane lipids and soluble carbohydrates under elevated temperatures. Microbiology. 2016. 162(6): 989-999.

Senik S.V., Maloshenok L.G., Kotlova E.R., Shavarda A.L., Moiseenko K.V., Bruskin S.A., Koroleva O.V., Psurtseva N.V. Diacylglyceryltrimethylhomoserine content and gene expression changes triggered by phosphate deprivation in the mycelium of the basidiomycete Flammulina velutipes. Phytochemistry. 2015. 117: 34-42.

Valitova J.N., Sulkarnayeva A.G., Kotlova E.R. et al. Sterol binding by methyl-b-cyclodextrin and nystatin – comparative analysis of biochemical and physiological consequences for plants. FEBS J. 2014. 281: 2051–2060.

Tereshina V.M., Memorskaya A.S., Kotlova E.R. Lipid metabolism in Aspergillus niger under conditions of heat shock. Microbiology. 2013. 82(5): 542-546.

Kislyuk I.M., Bubolo L.S., Bykov O.D., Kamentseva I.E., Kotlova E.R., Vinogradskaya M.A. Strong light elevates thermotolerance of photosynthetic apparatus and the content of membranes and polar lipids in wheat leaves. Russian J Plant Physiol. 2013. 60(5): 611-622.

Senik S.V., Kotlova E.R., Novikov A.V., Shavarda A.L., Psurtseva N.V. Formation of diacylglyceryltrimethylhomoserines in the surface culture of the basidiomycete Flammulina velutipes. Microbiology. 2012. 81(5): 534-541.

Valitova J.N., Minibayeva F.V., Kotlova E.R., Novikov A.V., Shavarda A.L., Murtazina L.I., Ryzhkina I.S. Effects of sterol-binding agent nystatin on wheat roots: The changes in membrane permeability, sterols and glycoceramides. Phytochemistry. 2011. 72(14-15): 1751-1759.

Valitova Y.N., Kotlova E.R., Novikov A.V., Shavarda A.L., Artemenko K.A., Zubarev R.A., Minibayeva F.V. Binding of sterols affects membrane functioning and sphingolipid composition in wheat roots. Biochemistry (Mosc). 2010. 75(5): 554-561.

Котлова Е.Р., Синютина Н.Ф. Изменение содержания индивидуальных классов липидов лишайника Peltigera aphthosa в процессе обезвоживания и последующего реувлажнения. Физиол. раст. 2005. 52(1): 43-50.

Котлова Е.Р., Попов Е.С. Особенности распределения бетаиновых липидов и фосфатидилхолинов у аскомицетов. Микология и фитопатология. 2005. 39(4): 68-77.

Kotlova E.R., Sinyutina N.F. The role of betaine lipids in adaptation of lichen Peltigera aphthosa to long-term dehydration. Advanced Researches on Plant Lipids. Murata N., Yamada M., Nishida I., Okuyama H., Sekiya J., Wada H. (eds.). Dordrecht, Boston, London: Kluwer Academic Publishers. 2003. 373-376.

Gorbushina A. A., Kotlova E. R., Schulte A. Biochemical adaptation of microcolonial rock inhabiting fungi subjected to desiccation stress. Ecological biochemistry of fungi. Krumbein W., Stark P. (eds.). Oldenburg University Press, Oldenburg, 2002. 47-52.